Grippe équine PCR

La PCR grippe équine permet de détecter directement le matériel génétique du virus influenza équin dans les sécrétions respiratoires.

Contrairement à la sérologie, qui met en évidence une réponse immunitaire, la PCR recherche la présence du virus lui-même. Elle est donc l’examen de choix pour confirmer une infection active, en particulier lors de signes respiratoires récents ou de suspicion de foyer.

La grippe équine est une maladie respiratoire virale très contagieuse. Elle doit être suspectée devant :

• Hyperthermie avec abattement et baisse d’appétit
• Toux sèche,
• Jetage nasal séreux puis parfois mucopurulent,
• Baisse de performance,
• Apparition rapide de plusieurs cas dans un effectif.

Les jeunes chevaux, les chevaux récemment introduits, les chevaux de sport, les chevaux en compétition ou en transport fréquent sont particulièrement exposés.

Le virus se transmet principalement :

• Par aérosols,
• Par contact rapproché entre chevaux,
• Par le matériel contaminé,
• Par les personnes en contact avec plusieurs chevaux,
• Lors des transports, concours, ventes, entraînements collectifs ou rassemblements.

La diffusion peut être très rapide dans un effectif insuffisamment protégé.

Le virus influenza équin infecte l’épithélium respiratoire. Il provoque une atteinte des cellules ciliées et une altération de la clairance mucociliaire.

Cette atteinte explique :

• La forte contagiosité,
• La toux marquée,
• La convalescence prolongée,
• Le risque de surinfection bactérienne,
• La baisse de performance après l’épisode clinique.

La PCR grippe équine permet de :

• Confirmer une infection active,
• Identifier rapidement un foyer respiratoire,
• Mettre en place des mesures d’isolement adaptées,
• Différencier la grippe d’autres causes respiratoires,
• Orienter la gestion sanitaire d’un effectif,
• Appuyer une décision de report de déplacement, concours ou rassemblement.

Le prélèvement de choix est l’écouvillon nasopharyngé, idéalement réalisé tôt après l’apparition des signes cliniques.

La probabilité de détection est maximale dans les premiers jours de fièvre (24H après l’apparition de l’hyperthermie de préférence), toux ou jetage.

Une PCR positive indique la présence du virus influenza équin dans le prélèvement.

Elle est compatible avec :

• Une infection active,
• Une excrétion virale,
• Un risque de contagion pour les chevaux contacts.

Une PCR positive doit conduire à renforcer immédiatement les mesures d’isolement et de biosécurité.

Une PCR négative peut être compatible avec :

• Absence d’infection grippale,
• Prélèvement trop tardif ou trop précoce (i.e. dans un effectif si un cheval est au tout début d’incubation) à rediscuter
• Excrétion virale faible ou intermittente (qui peut être due à une vacination notamment),
• Qualité de prélèvement insuffisante.

Une PCR négative n’exclut pas totalement la grippe si le contexte clinique et épidémiologique est très évocateur.

Le Ct (Cycle threshold) est le nombre de cycles d’amplification nécessaires pour que le signal fluorescent d’une PCR en temps réel devienne détectable.

Chaque cycle double théoriquement la quantité d’ADN ou d’ARN cible.

Plus il y a d’agent infectieux dans l’échantillon au départ, moins il faudra de cycles pour le détecter.

En résumé :

• Ct faible = beaucoup d’ADN ou d’ARN
• Ct élevé = peu d’ADN ou d’ARN

* Un Ct supérieur à 35 doit toujours être interprété avec prudence et replacé dans le contexte clinique, épidémiologique et des autres examens complémentaires.

La PCR détecte directement le virus et répond à la question : “Le cheval excrète-t-il actuellement le virus ?”

La sérologie détecte les anticorps et répond à la question : “Le cheval a-t-il été exposé au virus ou vacciné, et quel est son niveau d’immunité ou de protection immunitaire ?”

En cas de suspicion d’infection récente, la PCR est l’examen prioritaire.
La sérologie peut compléter l’investigation, notamment sur deux prélèvements successifs, pour documenter une séroconversion.

En cas de suspicion ou de PCR positive :

• Isoler immédiatement les chevaux suspects,
• Limiter les mouvements,
• Suspendre les déplacements, concours ou introductions,
• Surveiller la température des chevaux contacts,
• Séparer les groupes,
• Désinfecter le matériel partagé,
• Limiter les intervenants,
• Renforcer la ventilation des bâtiments,
• Adapter la reprise du travail après guérison clinique.

LABÉO réalise :

• PCR grippe équine,
• Panels PCR respiratoires équins,
• Sérologies grippe équine : SRH, ELISA, RFC,
• Analyse de séquençage du virus. Ces résultats sont échangés au niveau international avec les laboratoires partenaires pour évaluer chaque année l’efficacité des vaccins
• Accompagnement technique et interprétation vétérinaire.

Paillot R. A Systematic Review of Recent Advances in Equine Influenza Vaccination. Vaccines (Basel). 2014 Nov 14;2(4):797-831. doi: 10.3390/vaccines2040797. PMID: 26344892; PMCID: PMC4494246.

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